2018.6.8-6.10第三代测序技术及信息分析研讨班
近年来,以PacBio为代表的第三代测序技术不断发展,形成了众多的突破性的成果。由于它融合了新颖的单分子测序技术和高级的分析技术,使人们首次实现了观测单个DNA聚合酶合成过程的梦想。它有着NGS技术无法比拟的高达3000 bp序列读长,成为新的科研利器。在去年发表的新的动植物基因组研究中,约有1/4运用了第三代PacBio测序技术,其中有的荣登了Science封面。基于PacBio测序与生物信息分析,解决了基因组学研究中结构变异、复杂二倍体基因组的单倍体定相等难题。本次研讨班以第三代测序技术及信息分析为主题,以理论+上机实践的方式,与您共同研讨学习三代测序。
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心 & 北京希望组生物科技有限公司
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司
举办地点:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼,北京市计算中心三层会议室
举办时间:2018.6.8-10 上午9:30-12:00, 下午13:30-17:00
培训内容及安排:
日期 |
主题 |
授课内容 |
6月8日上午 |
PacBio测序技术介绍 |
高通量测序技术发展、机遇及挑战 PacBio测序技术、平台及原理介绍 |
三代测序应用中样本提取和建库流程 |
PacBio测序(RSII和Sequel)的样本提取、质检及建库流程等 |
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6月8日下午 |
BioNano及HiC相关实验流程 |
BioNano光学图谱的样本提取、质检及建库流程等 HiC文库的样本提取、质检及建库流程等 |
6月9日上午 |
Linux系统基本操作 |
Linux系统简介 Linux基础操作 常用Linux命令学习与实践 |
6月9日下午 |
PacBio测序在动植物基因组中研究应用 |
基于PacBio的动植物基因组文章深度解读 |
基于PacBio动植物基因组组装注释流程 常用基因组组装软件(如FACLON,PBJelly等)原理介绍 常用基因组注释方法介绍 基于PacBio动植物基因组组装的实例演示 (可选200M左右简单基因组进行实操,分别用FACLON和PBJelly组装注释) |
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6月10日上午 |
PacBio测序在全长转录组中研究应用 |
基于PacBio全长转录组文章深度解读 |
基于PacBio全长转录组分析流程 常用软件原理介绍 基于PacBio全长转录组分析实例演示 (可选1个Sequel SMRT Cell数据量进行全长转录本分类、聚类与校正) |
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6月10日下午 |
PacBio测序在动植物基因组甲基化研究应用 |
基于PacBio全基因组甲基化分析流程 常用软件原理介绍 基于PacBio全基因组甲基化分析实例演示 (可选基因组中200M左右简单基因组数据进行实操) |
PacBio测序在微生物基因组研究应用 |
1.概述微生物基因 |
(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【培训特色】
1、以实用技术为指导;
2、理论+上机相结合;
3、一线技术人员实践授课;
4、采取小班授课。
【报名费用】 培训费3800元/人,含听课费、材料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社 。
【付费方式】现金、刷卡、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心 账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元;
2、4+1团报,可免费赠送一个名额;
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
请联系:
QQ号:1103246565
王老师 010-52068621 13641189909(微信同号) 邮箱:Paragonbio@163.com
【注】开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请电话咨询