基因组关联分析技术应用培训班
以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段，其与以“求同法”思想为核心的“序列比对（Blast）”同样重要，但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部，主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员，特开设基因组关联分析培训班。
主办单位：中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位：北京市计算中心
协办单位：云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司
举办地点：北京，北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间：2018.5.24-26上午9：30-12：00，下午13：30-17：00
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日期 |
授课题目 |
授课内容 |
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5月24日 |
基因组关联分析理论基础 |
1、 基因组学与生物信息学概述； 2、 基于群体遗传的数据获取； 3、 基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍； 4、 常用GWAS数据库介绍； |
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Plink软件基础应用 |
5、 Plink软件应用； 6、 Plink文件格式生成与解析； 7、 等位基因频率计算； 8、 哈-温平衡计算； 9、 目标区域数据提取； 10、 基因组关联分析流程； 11、关联分析结果分析与p校正； |
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5月25日 |
基因型填充Imputation |
12、 基因型填充Imputation的原理及应用； 13、 Beagle软件介绍与应用； 14、 基因组填充的方法与分析流程； 15、 1000G数据应用 |
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Plink软件进阶应用 |
16、 基于家系的关联分析； 17、 曼哈顿图的绘制与结果展示； 18、 SNP位点的condition分析； 19、 Meta gwas数据分析； |
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5月26日 |
Haploview软件 |
20、 Haploview软件应用； 21、 Haplotype单倍型分析； 22、 LD连锁不平衡指数计算； 23、 SNP marker之间的r2、D值等计算； |
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Tassel软件 |
24、 Tassel软件应用； 25、 Tassel基于命令行的批量数据分析； 26、 生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等； |
(课程内容以实际授课为准)
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【培训特色】
无需任何计算机语言基础
深入简出，内容精要实用
结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授
统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用
边学边练，重实践，力求实效
小班授课，个别辅导
【报名费用】注册费：40000元/人（含听课费、资料费(材料：《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。)、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）。
【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称：北京市计算中心 账号：0200151819100023937
开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
（汇款信息里 备注上：“生物计算事业部——您的姓名”）
【报名优惠政策】
1、4.20日前报名并缴费，可享受减免200元优惠；
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
4、上面3种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
请联系：QQ号：1103246565
王老师 010-52068621 13641189909（微信同号） 邮箱：Paragonbio@163.com
注：培训前一周前后，会有邮件/电话通知开班与否；如未收到，请电话联系确认。
