Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司
举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间:2018.5.7-9(报名中)上午9:30-12:00,下午13:30-17:00
培训内容及安排:
日期 |
授课题目 |
授课内容 |
5月7日 |
概述 |
1. 生物信息学数据处理概述; 2. Perl语言简介特点与数据处理的优势与应用范围 |
运行调试 |
3. Perl语言解释器、编辑器安装; 4. Perl运行环境测试与程序编写; 5. UltraEdit软件应用与生物信息学数据文件处理; 6. 基于宏的perl语言快速编程 |
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操作基础 |
7. Perl语言基本变量、操作符、判断结构;循环结构; 8. Perl语言常用函数的功能应用; 9. 生物学数据文件的读入与输出; 10. 生物信息学常见文件的分割、合并、过滤、信息提取等; 11. 批量自动化数据文件操作 |
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5月8日 |
生物信息实例应用 |
12. 常用生物信息学数据文件格式简介; 13. 用perl从NCBI、ENA等数据库批量下载基因序列; 14. 用perl进行生物学数据文件格式转化; 15. 用perl编程从Fasta、GBK、Fastq、PDB等提取关键生物学数据信息; 16. 用perl批量自动化下载基因序列; 17. 用perl进行DNA到protein批量翻译; 18. 用perl批量DNA序列反向互补; |
高级数据处理 |
19. Perl语言的数组、二维数组、hash表用法; 20. 用perl自动化从表格数据提取信息; 21. 矩阵数据文件的生成与应用 22. 二代测序NGS、GWAS等生物信息分析中perl的应用 |
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5月9日 |
模块与子程序 |
23. perl子程序与模块应用; 24. 强大的正则表达式的应用; 25. 用perl进行基因ID列表比较、筛选与统计; |
Perl的高级应用 |
26. Perl第三方代码库CPAN的简介与应用; 27. Bioperl模块与应用; 28. 常用生物信息学程序实例; 29. 用perl进行批量自动化本地blast比对及数据分析; 30. 基于perl的circos基因组作图工具介绍; |
(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【培训特色】
1、对口生物信息; 2、非严格语法,适合初学;
3、功能强大、跨平台;4、有巨大的第三方代码库CPAN
【报名费用】 注册费4000元/人,含听课费、材料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社
【付费方式】现金、刷卡、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心 账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)
【报名优惠政策】
1、4.20日前报名并缴费,可享受减免200元优惠;
2、3人以上团体报名每人可减少200元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
请联系:QQ号:1103246565
王老师 010-52068621 13641189909 邮箱:Paragonbio@163.com
注:培训前一周前后,会有邮件/电话通知开班与否;如未收到,请电话联系确认。